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VISUALIZAÇÕES NA SEMANA

quarta-feira, 7 de março de 2012

GENÉTICA MOLECULAR - BIOLOGIA - AULA 02

REPLICAÇÃO DO DNA

O DNA apresenta características estruturais únicas que o tornam adequado para ser a molécula da hereditariedade, como o fato de ser bifilamentar e a interação específica entre as bases nitrogenadas, através das pontes de hidrogênio estabelecidas. O modelo estrutural proposto por Watson e Crick para a molécula de DNA sugeria que a replicação do DNA fosse realizada de uma forma tal que cada filamento, individualmente, fosse utilizado como modelo para síntese de seu filamento complementar. A demonstração experimental foi feita por Meselson e Stahl (1958), em experimentos utilizando incorporação de nitrogênio com densidade diferenciada. Este trabalho foi muito importante para consolidar a aceitação sobre a proposição molecular de Watson e Crick. No estudo, os pesquisadores cultivaram células bacterianas por várias gerações em meio de cultivo contendo apenas N15 disponível para síntese de biomoléculas. Ao transferirem as bactérias para meio contendo N14, a formação de moléculas híbridas de DNA, contendo um filamento com N14 e um filamento com N15 foi a base para a determinação do modelo SEMICONSERVATIVO de duplicação.
Desta forma, uma molécula de DNA SEMPRE apresenta um filamento velho (oriundo da molécula que a originou) e um filamento novo (recém sintetizado).
 


A enzima responsável pela síntese de DNA é a DNA polimerase. Em procariotos, encontramos 3 tipos de DNA polimerase: DNA pol I; DNA pol II e DNA pol III. Através de experimentação com mutantes bacterianos, sabe-se que DNA pol I tem papel representativo na correção de erros e que DNA pol III é a principal enzima para síntese de DNA (recentemente, duas novas polimerases, DNA pol IV e DNA pol V, ambas associadas com reparo de lesões no DNA foram inseridas neste rol). Em eucariotos há um grande número de polimerases. Para replicação, são necessárias as polimerases alfa, delta e epsilon. A polimerase beta está associada a correção de erros e a polimerase gama é responsável pela replicação do DNA mitocondrial. Caracteristicamente as DNA polimerases apresentam atividade polimerásica 5´-3´ e atividade exonucleásica 3´-5´. Esta última assegura a correção de possíveis erros de pareamento durante a síntese de DNA. O sistema funciona pela competição dos sítios catalíticos: Como a afinidade do sítio polimerásico é maior que a do sítio exonucleásico, apenas quando o nucleotídeo alocado não realiza o pareamento adequado é possível removê-lo. Há, ainda, a atividade exonucleásica 5´-3´ exibida pela DNA polimerase I, que permite a remoção dos iniciadores e auxilia no reparo a erros identificados após a replicação.
A descoberta dos mecanismos de síntese biológica dos ácidos nucleicos rendeu o prêmio Nobel de 1959 a Severo Ochoa e Arthur Kornberg. Para que ocorra a replicação é necessária a ação de uma série de enzimas e proteínas que prepararão a molécula de DNA para a ação da polimerase. A região na qual a replicação se inicia é denominada origem de replicação (ori). Em procariontes, esta região ocupa um segmento de cerca de 220pb, sendo constituída por sequências conservadas dispostas de maneira específica na molécula de DNA. Na ori observamos a ocorrência de 3 repetições de uma sequência conservada de 13 nucleotídeos (GATCTNTTNTTTT) seguida de quatro repetições de uma sequência de 9 nucleotídeos (TTATNCANA). Nesta região é formada a bolha de replicação através da ação do aparato enzimático da replicação.



A girase promove a torção negativa necessária para que a molécula de DNA possa ser duplicada. Já a helicase tem o papel de romper as pontes de hidrogênio entre as bases nitrogenadas. As proteínas SSB estabilizam os filamentos de DNA separados e a primase realiza a síntese do iniciador ou primer. Assim forma-se um complexo replicativo que permite a ação da DNA polimerase e a forquilha de replicação avança para que a replicação tome curso. Como os filamentos do DNA são antiparalelos, enquanto uma das fitas é sintetizada de forma contínua, a outra fita é sintetizada em pedaços, denominados fragmentos de Okazaki. Assim, a replicação, além de semiconservativa, é SEMIDESCONTÍNUA. A ligase tem papel de unir os segmentos sintetizados para que a replicação possa ser concluída. é importante lembrar que, atraves da atividade exonucleásica 5´-3´, o iniciador é removido, sendo substituído por um segmento de DNA.



Nas células eucariontes, como o DNA é linear, uma das extremidades da fita descontínua terminal não é completamente duplicada pelo aparato de replicação do replissoma. Nesta região age uma enzima ribonucleoproteica especial, descoberta na década de 80, denominada telomerase. A descoberta foi agraciada com o prêmio Nobel em 2009!



Seus principais componentes são codificados pelos genes TLC1 (molde de RNA) e EST2 (porção catalítica). Esta enzima utiliza seu próprio constituinte de RNA para servir de molde à duplicação das sequências repetitivas TTAGGG/TTGGGG que compõe o telômero. 



A atividade telomerase é observada em todas as células em divisão, sendo diminuída progressivamente em células com maior diferenciação.

quarta-feira, 29 de fevereiro de 2012

GENÉTICA MOLECULAR - BIOLOGIA - AULA 01

ESTRUTURA DE ÁCIDOS NUCLEICOS

Apesar dos questionamentos sobre a transmissão de características remontarem à Grécia antiga, a Genética só surgiu como ciência após a redescoberta dos trabalhos de Mendel.
Os principais trabalhos que revelaram que o DNA era a molécula responsável pela hereditariedade foram conduzidos entre as décadas de 20 e 50 do século passado. Os experimentos de Griffiths e colaboradores (1928) e Avery e colaboradores (1944) mostraram o papel do DNA na determinação da capacidade de virulência em Pneumococos. Inicialmente, Griffiths e colaboradores observaram que, ao injetarem em cobaias uma mistura de culturas de células avirulentas (incapazes de provocar pneumonia) com células virulentas mortas por calor, as cobaias desenvolviam pneumonia e células vivas virulentas eram recuperadas das carcaças. O fenômeno foi denominado princípio transformante, mas sua base não foi explicada. Em 1944, Avery et al., utlizando plaqueamento em meio de cultura rico, observaram que o princípio transformante ocorria independente da utilização de uma cobaia. Ao fracionarem o extrato de células mortas por calor, determinaram que a fração que detinha a capacidade de transformação era um precipitado alcoólico, que possuía DNA, RNA e proteínas. Ao tratarem o precipitado com enzimas específicas para degradar seus componentes (protease, RNase e DNase), descobriram que somente a fração tratada com DNase perdia a capacidade de transformar. O DNA era, então, o princípio transformante!
O fenômeno é explicado pela capacidade das bactérias capturarem fragmentos de DNA do meio ambiente. As células virulentas mortas tem seu DNA fragmentado e, ao romperem, o liberam no meio. Algumas moléculas irão gerar fragmentos que contém as informações necessárias para produzir a cápsula, envoltório responsável pela capacidade de virulência. Assim, uma célula avirulenta, ao capturar e integrar um segmento de DNA que a capacita a produzir cápsula, torna-se virulenta!
Hershey e Chase (1952), por sua vez, revelaram o papel na hereditariedade em experimentos com bacteriófago, demonstrando que o material injetado pelo vírus na célula para assegurar sua multiplicação era o DNA. Este experimento clássico se valeu da possibilidade de marcar radioativamente de forma diferencial as proteínas (que constituem o capsídeo viral) e o DNA, utilizando enxofre radioativo (S35) e fósforo radioativo (P32), respectivamente.
Os ácidos nucleicos são as moléculas chave para a hereditariedade e expressão gênica. Basicamente temos dois tipos de ácido nucleico: O DNA, ácido desoxiribonucleico - responsável pela transmissão da informação genética, e o RNA, ácido ribonucleico - responsável pela expressão das informações. São moléculas polinucleotídicas, isto é, compostas por várias unidades monoméricas denominadas nucleotídeos. Cada nucleotídeo apresenta em sua estrutura três elementos: um açúcar de 5 carbonos (pentose), um grupamento fostato (ácido fosfórico) e uma base nitrogenada. O grupamento fosfato está ligado ao carbono 5 da pentose e a base nitrogenada ao carbono 1. No carbono 3 encontramos um grupamento hidroxila. O açúcar (a 2-desoxiribose no DNA e a ribose no RNA) e o fosfato compõe a porção constante, comum a todos os nucleotídeos. A base nitrogenada é a porção variável, diferindo em cada tipo de nucleotídeo. Os tipos mais comuns de base nitrogenada são a adenina (A), a citosina (C), a guanina (G), a timina (T) e a uracila (U). A, C, G e T estão presentes no DNA e A, C, G e U estão presentes no RNA.
A descoberta da estrutura do DNA envolveu a análise de evidências químicas e físicas. A evidência química veio através dos trabalhos de Chargaff e colaboradores. Ao avaliarem o DNA de diversos tipos de organismos, os pesquisadores determinaram que as concentrações de adenina e timina eram sempre semelhantes, assim como as concentrações de citosina e guanina, ou seja, existia uma proporção 1:1 entre as bases A e T e C e G. Já a evidência física é devida aos trabalhos de Franlink com difração de raios X, que revelaram a estrutura bifilamentar com torção helicoidal da molécula.
Assim, em 1953, Watson e Crick publicaram o trabalho que revelou a estrutura molecular do DNA e suas implicações moleculares. A molécula é composta por dois filamentos polinucleotídicos torcidos um sobre o outro de forma regular, que se mantem interligados através de pareamento específico por pontes de hidrogênio entre as bases nitrogenadas. Adenina pareia com Timina através de duas pontes e Citosina pareia com Guanina através de três pontes.
O link para o artigo original, publicado na edição de 25 de abril de 1953 na revista nature é:
http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf

Boa semana!!!!!

segunda-feira, 13 de fevereiro de 2012

Boas Vindas!


Olá todos,
Estes são os assuntos que abordaremos em nosso curso.

ESTRUTURA DE ÁCIDOS NUCLEICOS
REPLICAÇÃO
TRANSCRIÇÃO E PROCESSAMENTO
SÍNTESE DE PROTEÍNAS
FUNDAMENTOS DA EXPRESSÃO GÊNICA
MUTAÇÃO E REPARO DE DNA
POLIMORFISMOS GENÉTICOS
GENÉTICA E BIODIVERSIDADE
GENÉTICA E SAÚDE
MECANISMOS GENÉTICOS COMPLEXOS

Bibliografia principal
GRIFFITHS, A. J. F. e colaboradores 2008. Introdução à Genética. 9 ed., Ed. Guanabara-Koogan, Rio de Janeiro.
2. PIERCE, BENJAMIN A. 2004. Genética: Um enfoque conceitual. 1ª ed., Ed. Guanabara-Koogan, Rio de Janeiro.

Bibliografia complementar
www.aprendendogenetica.blogspot.com

quarta-feira, 8 de fevereiro de 2012

NOVIDADE: NCBI NO YOUTUBE!

Nesse link temos o tuturial para busca bibliográfica no NCBI (National Center for Biotechnology Information). Vale a visita!
http://www.youtube.com/ncbinlm

terça-feira, 7 de fevereiro de 2012

BOAS VINDAS 2012-1

PREZADOS TODOS
INICIAMOS MAIS UM SEMESTRE LETIVO, QUE TERÁ MUITAS ATIVIDADES E COBRIRÁ BOA PARTE DO QUE TEMOS DE CONHECIMENTO NA ÁREA DE GENÉTICA MOLECULAR. SERÁ UM GRANDE PRAZER PODERMOS DISCUTIR OS DIVERSOS ASSUNTOS QUE NOSSA DISCIPLINA ABORDA, INCLUINDO AS BASES MOLECULARES DA HEREDITARIEDADE, O SURGIMENTO DA VARIAÇÃO GENÉTICA E SUAS IMPLICAÇÕES, A BIODIVERSIDADE EM SI, ENFIM, MUITAS COISAS....... SERÁ QUE PODEMOS CORRELACIONAR GENÓTIPO E FENÓTIPO MESMO?
IREMOS FAZER UMA RELEITURA DA GENÉTICA MENDELIANA, COMPREENDER OS MECANISMOS COMPLEXOS QUE NORTEIAM A EXPRESSÃO GÊNICA, QUESTIONAR O PAPEL DA VARIABILIDADE SOB O PRISMA EVOLUTIVO E TENTAR ENTENDER UM POUCO DO QUE SOMOS, COMO ENTIDADES BIOLÓGICAS, DO PONTO DE VISTA GENÉTICO.
ALGUNS DOS NOSSOS ASSUNTOS SERÃO:
- ESTRUTURA MOLECULAR DE ÁCIDOS NUCLEICOS
- REPLICAÇÃO DE DNA
- EXPRESSÃO DA INFORMAÇÀO GENÉTICA
- DECODIFICAÇÃO DA INFORMAÇÃO GENÉTICA
- VARIAÇÃO DA INFORMAÇÃO GENÉTICA
- IDENTIFICAÇÀO DA VARIABILIDADE GENÉTICA
- BIODIVERSIDADE E GENÉTICA
EM BREVE NOSSO CRONOGRAMA DE CURSO ESTARÁ DISPONÍVEL AQUI, ASSIM COMO OS PRINCIPAIS CONTEÚDOS ABORDADOS EM NOSSAS AULAS.
UM GRANDE ABRAÇO

MARCELO

sexta-feira, 16 de dezembro de 2011

terça-feira, 13 de dezembro de 2011

RESPOSTAS PARA A TURMA

Venho recebendo uma avalanche de perguntas sobre o mesmo assunto e, realmente, não sei o que as motiva, já que não alteramos nosso calendário acadêmico.
1 - data da P6
resposta: próxima sexta
2 - matéria da P6
resposta: matéria toda

segunda-feira, 12 de dezembro de 2011

RESULTADO DO DNA

O mais votado foi o DNA jujuba!
O meu escolhido foi o DNA origami!
O hors concours foi o DNA natalino!
Mas todos ganharam o ponto pelo empenho e criatividade. Valeu!

NOTAS P2 E VEA

Posto as notas de segunda chamada e P2.
 
Um abraço, boas férias a uns e até sexta aos demais!

domingo, 20 de novembro de 2011

MOLÉCULA DE DNA - ATIVIDADE

Parabéns pela criatividade dos trabalhos. agora é eleger o mais interessante e criativo!
Boa sorte a todos.

DNA 01 - DNA TOALHA

DNA 02 - DNA JUJUBA

DNA 03 - DNA NEGRO

DNA 04 - DNA NATALINO

DNA 05 - DNA ORIGAMI

DNA 06 - DNA MOLECULAR

DNA 07 - DNA ESPACIAL


DNA 08 - DNA COTONETE

DNA 09- DNA ENROLADO